targeted sequencing
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Targeted sequencing - KAS sequencinggenome data analysis 2021. 1. 18. 04:52
Kethoxal-assisted single-stranded DNA sequencing (KAS-seq) captures global transcription dynamics and enhancer activity in situ www.nature.com/articles/s41592-020-0797-9?proof=t Kethoxal이란 chemical 을 사용한 sequencing 방법입니다. 기존에 ATAC-seq 방법과 유사한 결과를 얻을 수 있는데.. 논문에서는 훨씬 해상도가 좋다고 합니다...만 제가 아직 ATAC-seq은 따로 공부를 안해서 공부를 좀 하고 이 부분은 더 채우도록 하겠습니다. 그 둘 방법으로 비교한 결과 그림입니다. ATAC-seq에서 Catch 못 한 부분도 꽤 염기서열을 해독..
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시퀀싱 단계에서 불필요한 리드는 시퀀싱 안해버리는 기술 -나노포어genome data analysis 2021. 1. 16. 23:42
Targeted nanopore sequencing by real-time mapping of raw electrical signal with UNCALLED Timp 교수님께서 온라인으로 진행한 발표를 듣다가 다음과 같은 동영상을 보여주셨는데..이게 가능하다고?? 하면서 본 자료에 대해서 이야기 하고자 합니다. 시간이 좀 지나서 아시는 분들도 있겠지만 처음 접하시는 분들도 많을거라 생각합니다. Targeted Sequencing 방법 중 하나입니다. 동영상 40초 쯤 부분부터 해당 내용이 나옵니다. nanoporetech.com/about-us/news/towards-real-time-targeting-enrichment-or-other-sampling-nanopore-sequencing-devices..