Variant Call Format
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Variants Call Format (VCF) 파일 하나로 합치기genome data analysis/Genome analysis 2020. 4. 17. 15:55
Plink와 the Variant Call Format (VCF) 파일을 이용해 Cases-Controls 간, Cases - Cases간 관련성있는 변이들을 찾을 수 있습니다. 이때 VCF 파일들을 하나로 합치는게 필요한데 그 때 쓰는게 vcftools 입니다. 보통 하나의 VCF 파일들은 한 개체의 변이들에 대한 정보입니다. 이 과정들은 우분투 서버에서 진행했습니다. 1. vcftools 다운로드 터미널창에 vcftools라고 쳤을 때 깔려있는게 없다면 클릭할 수 있는 URL을 보여줍니다. 그걸 클릭하면 .deb형식의 파일을 받을 수 있습니다. 아마 설치가 자동으로 될 텐데..이렇게는 해본 적은 없습니다. 따로 .deb 형식의 파일을 받았다면 아래와 같이 진행하면 됩니다. sudo dpkg –i 패키..